自序卷上痈疽原委论痈疽治法总论治病则例歌痈疽灸法并禁灸疮穴论病生死法察形色顺逆病有三因受病主治不同论调理须知杂忌须知疮疡看法肿疡治法溃疡治法痈疽诸症疮名十律炼元明粉法取蟾酥法制附子法制炒诸药仙方活命饮
虚劳总论虚劳脉法虚劳死候虚劳所宜及养生之法虚劳所忌饮食诸物虚劳选方保阴煎六味地黄丸左归丸左归饮回生丸清金散加味清宁膏噙化丸天王补心丹归脾汤逍遥散仲淳验方乳金丹坤髓膏白凤膏（自制）四圣丸卫生膏资生丸大黄
简介序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七卷十八卷十九卷二十卷二十一卷二十二卷二十三附录
简介细目序言上卷中卷下卷
徐序刘序朱子跋郭长阳医书自序卷一伤寒名例十问叙论五问治法大要九问伤寒脉法及刺法六问张仲景华元化五问卷二仲景辨脉法三十八条卷三仲景平脉法四十五条卷四六经统论二十二问太阳经证治上九十五条卷五太阳经证治下九
卷一明堂灸经序铜人针灸经序太平圣惠方针经序流注针经序常山阎明广序燕山牛良 序资生经序赵编序大德丁未阆中郡蒲登辰序流注指微针赋针经标幽赋流注通玄指要赋九针论灸刺论卷二论针之名论三阳三阴经脉论虚实补泻论下
吴序恽序盛序程序自序凡例用药法程草部山草类人参丹参沙参元参苦参苍术白术甘草黄远志玉竹知母贝母秦艽白藓皮升麻柴胡前胡独活细辛防风羌活桔梗黄连胡黄连黄芩天麻龙胆草茅根延胡索地榆巴戟天肉苁蓉淫羊藿贯众金毛脊
茧唇一口疮二齿痛三舌症四喉痹诸症五喉痛六诸骨稻谷发鲠七治诸鲠咒法八误吞水蛭九诸虫入耳十蛇入七窍及虫咬伤十一男女体气十二附方并注
小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
序卷一十二官六脏六腑纳甲诗内景说心说肝说脾说肺说肾说胃说胆说大肠小肠说三焦说手心主说(即心包络)膀胱说命门说附录高士宗部位说经络易知十二经脉起止图十六络穴图经络说十二经诗十六络诗十二经气血流注诗（旧本